不过影片第一话中的主角自白未免矫情了，“我不知该如何珍藏明里的这份温暖，也不知该将她的灵魂带往何处去。我清楚地明白，我们无法保证将来能永远在一起。横亘在我们面前的是那沉重的人生与漫长的时间，让人不由得产生一种无力感。”这样的话对于一个十三岁的少年，有如此见地和觉悟实属少见。

再说本片主人公贵树和明理，两人青梅竹马应该属是遭人羡慕的，而正是这样，不光是本片的导演，在此类情况下，很多导演都将主人公贴上“孤单”的标签。被同学孤立，或者不被家人理解，唯美却凄清的音乐和场景总在他们只身一人遥望某处的时候出现。而这样的电影不像电视剧，有时间去介绍二号三号，去将他们串在一起，热闹清冷此起彼伏。一些非动画电影还存在旁白，而旁白往往就是当事人。悠远清晰的叙游离在喧嚣的生活画面，给人一种沧桑感，更显孤独。若人生如戏，那么与你同台的也就那么几个，贯穿全剧，与你始终在一起的人更是寥寥无几，甚至归零。或许正是因为同是天涯沦落人，才更加得彼此心心相惜。

彼时的他们，就是这样心心相惜，形影不离。但是毕业转校却不得不使他们分离。

第二话中，两位主人公在各自的城市上高中。同校的花苗暗恋上了成绩优秀，体育拔尖的贵树。然而花苗注意到，贵树其实并不喜欢自己，他的眼睛总在凝望着无限远处的个地方。也许那里有他爱的她。此话中，最值得玩味的是“那真的是让人无法想象的孤独旅程——在那幽深的黑暗之中，只朝着一个方向一直地前进。哪怕是一个小小的氢原子都难得一见。怀着探寻世界之秘密的心，深信不疑地潜入那无尽的深渊——而我们，又将到达何方?又能去往何处呢?”贵树告诉花苗他要去东京，但他其实是迷惘的，他只是在做好目前力所能及的事。就像宇航员，有目标，而深不可测的未知就在那里不来不去。但是我想，这是迷惘吗?迷惘不该是不知目标吗?也许，贵树心里更多的是对未来的胆怯。

第三话，主人公都有了各自的生活，贵树在一家企业做程序员，有了女友，而明理也将与别人结婚。

樱花下落的速度是每秒五厘米，而经历了十几年，如果用数学的方法计算此间的距离，那么，此时的他们已是天涯海角。但是此片如果是为了诠释感情是会随着时间而褪色变味的话，那就太让人大跌眼镜了。

然而，在影片最后的两分钟，男女主角在马路上擦肩而过，当走到各自相对的马路，彼此回眸，列车却在此时飞驰而过，挡住了他们的视线。当列车离开，空荡荡的大街只留下了贵树一人。贵树抿嘴一笑，在此刻，他终于释然。