新疆大学科学技术学院成立于2002年8月。2004年1月，通过教育部关于办学资质的审核，成为我国首批本科院校举办的独立学院。2012年5月,通过自治区学位委员会、自治区教育厅审核,学院取得学士学位授予权资格。6月，自治区人民政府决定新疆大学与阿克苏地区合作办学,由阿克苏地区负责完成校园基本建设，校园建成后，将新疆大学科学技术学院搬迁至阿克苏办学，由新疆大学负责教学和管理。条件成熟、申请教育部评估合格后转制为公办二本院校。

新疆大学科学技术学院现校址为新疆乌鲁木齐市西北路499号，搬迁后为阿克苏地区温宿县新城区学府路1号。阿克苏校区校园占地面积2856亩，分三期建设，其中一期占地面积1700亩，建筑面积近30万平方米，共投入建设资金15亿元，规划在校生6000-8000人；二期规划建筑面积21.7万平方米，远期规划建筑面积17万平方米；远期规划在校生15000人。

新疆大学科学技术学院交通便利、环境幽雅、人文荟萃。学院拥有专兼任教师257名（专任教师均为硕士及以上学历）其中教授23人，副教授79人，具有博士学位教师72人，硕士学位教师182人。现有18个本科专业，覆盖工学、文学、经济学、管理学、法学等五大学科门类。在校本科5500余人，是一所面向全国统一招生的综合性全日制应用型本科大学