学院大力实施订单教育，与天山北坡经济带上的300多家上市公司和知名企业,以及东南沿海发达地区的企业，建立了广泛而稳定的合作办学关系，每个二级学院都与数家企业建立了合作办学共同体,每个专业背后都有强大的企业群作支撑。每年与企事业单位签订有2000多份用人订单。

学院社会服务能力不断增强。牵头创建了新疆第一产业职教园区，并以此为平台，在各级党委、政府的大力支持下，先后在阿克苏筹建了新疆特色林果业示范培训中心，在阿勒泰、伊犁筹建了新疆草原畜牧业示范培训中心阿勒泰基地、伊犁基地。学院引进大型龙头企业，积极着手筹建设施农业示范培训中心（吐鲁番、塔城基地），自治区现代农业示范培训中心呼图壁基地，形成了“四中心六基地”格局，构建全面覆盖新疆大农业的服务网络体系，在服务新疆经济社会发展进程中实现学院平稳快速的健康发展。

学院招生、就业形势两旺。自2004年以来，连续五年毕业生初次就业率达到98%以上，名列自治区高校之首。　　

学院是中国职业教育学会理事单位、全国高职高专校长联席会议成员单位、教育部农业职业教育教学指导委员会委员学校、农业部“农业职业教育能力建设计划”试点院校、新疆职业教育学会挂靠单位、新疆高职高专校长联席会议主席单位、新疆第一产业职教园区理事长单位。

多年来，学院发扬“艰苦奋斗、开拓创新、自强不息、追求卓越”的学院精神，努力探索和创新农业高等职业教育办学思路和人才培养模式，构筑“双赢”机制，深化教育教学改革，走出了一条独具特色的人才培养之路，得到了教育部、农业部、自治区党委和人民政府的肯定以及社会各界的普遍赞誉。

2007年5月18日，中共中央政治局委员、自治区党委书记王乐泉亲临学院视察，为学院启动国家示范性高职院校建设揭牌。他在讲话中指出：新疆农业职业技术学院办学定位准确，办学理念和办学思想先进，人才培养模式新颖，自治区将重点推广学院的做法和经验。并为学院提写了“愿新疆农职院，百尺竿头，更进一步，做出更大贡献”的题词，与领导班子亲切合影留念。

教育部部长周济同志2005年6月24日视察学院时认为：“学院有一套完整的先进的办学理念和办学思想，以就业为导向，创新人才培养模式，在培养高技能人才方面走出了一条正确的有中国特色的社会主义职业教育发展道路，走在了全疆乃至全国职业院校的前列，为全国职业教育的发展创造了宝贵的经验”。