学校积极拓展校际、校地、校企交流合作，先后与国内20余所高校签订了校际合作协议，与新疆兵团八师石河子市、九师、沙湾县等兵团、自治区多家单位签订了校地合作协议，与新疆天业、天富、伊力特、天山铝业等多家企业建立了校企合作关系。
乘着振兴中西部高校和新疆兵团全面深化改革的春风，石河子大学正处在历史发展的新阶段。中央新疆工作座谈会明确要求：要提高石河子大学服务经济社会发展和长治久安的能力。石河子大学肩负着更加重大的历史使命和社会责任，正朝着建设“西部先进，中亚一流，国际知名的有特色、高水平大学”目标迈进。
