教学改革学校将人才培养模式的改革作为重点，配套推进教学内容改革及课程建设，全面强化实践教学。在人才培养模式方面，在财政学、会计学等专业开展了“双证班”教学改革，在经济学专业设置了“经济学基地班”，经济学院和统计与数学学院联合设置了“经济学—数学”双学位班;在蒙语授课专业试行了基地班实验计划;计算机科学与技术专业与企业开展专业共建，联合培养人才。采取了“2+2”的国际合作培养模式与国外大学合作办学。全面修订了人才培养方案，改革计算机教学模式，公共英语教学采取分级教学，在素质教育选修课程中增设了个性发展模块。在民族教育方面，形成了以开好汉语、计算机课程为主要内容的人才培养思路，夯实了基础理论和实践能力，突出了创业精神和创新意识。

科学研究学校始终把服务国家和自治区经济社会发展作为重要使命。近五年来，我校共承担国家级项目57项，其中国家社科基金项目34项，国家社科基金特别项目9项、国家社科基金后期资助项目1项;国家自然基金项目3项，教育部人文社科项目7项，国家民委民族问题研究项目3项;承担省部级项目261项，各级各类项目承逐年稳定增长趋势。发表各级各类论文5346篇，其中核心期刊3218篇，核心期刊比例达60%。共出版专著和教材441部;共获得自治区哲学社会科学优秀成果政府奖202项，其中一等奖5项，二等奖52项。

我校目前以人才、学科、科研三位一体的创新能力提升为核心，汇聚社会多方资源，大力推进我校与其它高等学校、科研院所、行业企业的深度融合，探索建立适应于不同需求、形式多样的协同创新模式。学校现有“中蒙经贸合作与草原丝绸之路经济带构建”协同创新中心，有“全国社科普及基地”、“少数民族高等财经教育发展研究中心”等两个国家级研究基地，“内蒙古产业发展研究基地”、“内蒙古中小企业发展研究基地”、“内蒙古社情民意调研中心”、“内蒙古文化产业研究中心”等四个自治区级研究基地，有自治区高校创新平台“会计信息化实验实训创新教育实验室”，有两个自治区级学术创新团队，19个校级虚体研究机构。

学校办有《财经理论研究》、《内蒙古财经大学学报》和《民族财经研究》(蒙文版)三种期刊，其中，《财经理论研究》被评为全国高校社科百强期刊、全区高校精品学报、中国人文社会科学核心期刊(扩展板)，《内蒙古财经大学学报》为全区优秀学报，《民族财经研究》是全国唯一的蒙文版财经类专业期刊。