学校坚持以立德树人为根本，建立了从学士、硕士、博士到博士后完整的人才培养体系。建有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站。拥有博士点14个，覆盖中医、中药2个一级学科和中西医结合临床二级学科;硕士点50个，覆盖中医、中药、中西医结合、临床医学、护理学、药学6个一级学科和生物化工二级学科以及自主设置的听力学等9个目录外硕士点;具有中医博士专业学位授予权和中医、临床医学、口腔医学、护理、公共管理硕士专业学位授予权。开设本科专业28个，分属医、理、工、管、文等5个学科门类，其中国家级特色专业5个，浙江省“十二五”优势专业、新兴特色专业、国际化专业14个,“十三五”优势专业5个;中医学、临床医学、中药学3个专业通过教育部专业认证。拥有国家教学团队1支、国家精品课程9门、国家卓越医生(中医)教育培养计划项目3项、国家专业综合改革项目1项、国家级实验教学示范中心及大学生校外实践基地2个。获国家级教学成果奖二等奖3项。先后两次获得教育部本科教学工作水平评估优秀。近年来毕业生初次就业率保持在95%以上，毕业生参加中医类别医师资格考试通过率稳居全国中医院校前茅。

学校学科特色明显，基础扎实，科技创新能力不断提升。中医临床基础为国家重点学科;拥有省部级重点学科54个，其中浙江省“十二五”重中之重一级学科2个、重中之重学科1个，国家中医药管理局重点学科25个;入选浙江省“十三五”“一流学科建设工程”项目A类3个、B类6个 。建有以血液病为重点研究病种的国家中医临床研究基地。拥有国家中医药管理局协同创新中心1个、国家中医药管理局重点研究室3个、国家中医药科研重点实验室10个、浙江省重点实验室4个、浙江省“2011协同创新中心”1个，浙江省公共科技条件平台2个、浙江省重点科技创新团队4支。获国家科技进步奖、国家技术发明奖5项，浙江省科学技术一等奖8项。办有《浙江中医药大学学报》、《浙江临床医学》2种学术期刊，其中《学报》是全国对外发行最早的中医学术刊物之一，在20多个国家和地区发行，被美国《化学文摘》、波兰《哥白尼索引》等国际著名检索系统收录。先后与丽水市、磐安县、甘肃省渭源县、江西省樟树市等地开展产学研战略合作，积极服务地方经济社会和中医药事业发展。

学校积极发挥中医中药特色优势，不断推进国际交流与合作。已与美国、德国、英国、巴西、日本、韩国、香港、台湾等31个国家与地区的87个教育、科研、医疗单位建立了合作关系，招收了56个国家与地区的国(境)外学生，先后聘请了40余位外国专家学者为客座教授。学校是世界中医药学会联合会风湿病等3个专业委员会的副会长单位，也是世界针灸学会联合会教育及其国际针灸水平考试基地，建有浙江省来华留学生中医文化教育基地。