学校注重科技创新驱动，打造一流科研平台，取得丰硕成果。现有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，设有1个国家教育部重点实验室、6个国家中医药管理局三级重点实验室，2个国家中医药管理局重点研究室、2个山东省重点实验室、3个山东省工程技术研究中心、1个山东省示范工程技术研究中心、1个山东省工程实验室，1个山东省中医药抗病毒协同创新中心，7个山东省高校科研创新平台。“十二五”期间，共承担厅局级以上科研课题780项，其中国家级项目104项，连续三年获得山东省科技进步一等奖。建校以来，获国家级和省部级一等奖奖励的科研成果共计23项。拥有国家中医临床研究基地、国家重大新药创制平台(山东)中药单元平台。

在建设高水平中医药大学的征程上，学校始终坚持社会主义办学方向，全面贯彻党的教育方针，牢固树立创新、协调、绿色、开放、共享的发展理念，以立德树人为根本，以创新驱动发展、服务地方经济社会为导向，坚持人才培养的中心地位和中医药学科专业的核心地位，突出中医药特色优势，注重文化传承创新，强化内涵建设，深化教学改革，不断提高人才培养质量，全面提升学校的综合实力和办学水平，努力培养德智体美全面发展的中国特色社会主义合格建设者和可靠接班人。