学校有全日制在校生有11199人，其中本科生10269人，硕士研究生875人，博士研究生55人。校本部设有20个教学机构，4个直属机构，31个科研机构。有2所直属附属医院，8所非直属附属医院，106家实践教学基地（含10所附属医院）。学校现有25个本科专业、12个专科专业，有3个国家特色专业、6个省级特色专业、6个省级教学团队，有1个博士后科研流动站、3个一级学科博士学位授权点，4个一级学科硕士学术学位授权点、有5个一级学科硕士专业学位授权点，具有同等学力人员硕士学位授予和高校教师在职攻读硕士学位培养权。

学校建有17个省部级重点学科，9个省医疗卫生重点学科，19门省级精品课程，4门省级精品资源共享课，4个省级实验教学示范中心，总面积约2200平方米的科研实验中心。有1个省部共建重点实验室，3个国家中医药管理局中医药科研三级实验室，4个甘肃省重点实验室，2个甘肃省高校省级重点实验室，2个甘肃省高校人文社科重点研究基地，2个省级工程实验室，3个省部级工程技术研究中心。学校是全国第四次中药普查甘肃省试点工作技术依托单位、国家基本药物所需中药材种子种苗繁育基地建设甘肃省牵头指导单位、甘肃省地道中药材标准制定工作牵头单位、科技部“中医药防治慢性病示范型国际科技合作基地”。“十二五”期间，承担国家、省部级和其他科研课题898项，获得各类科研成果奖励73项，获国家专利27项。出版学术专著及教材339部，发表学术论文1526篇。主办《甘肃中医药大学学报》、《中医儿科杂志》、《甘肃基层卫生》三种学术期刊，其中《中医儿科杂志》为中华中医药学会系列期刊。学校直属附属医院拥有院内制剂106个，取得了较好的社会效益和经济效益。

学校高度重视党建和思想政治教育工作，积极开展丰富多彩的校园文化活动、社会实践活动和公益服务活动，推进“大学生素质拓展计划”，先后被评为“全省高校思想政治教育工作先进单位”、“全省高校统战工作先进单位”。校工会和附院工会被授予“全国教科文卫体系统先进工会组织”荣誉称号。

学校以“丝绸之路经济带”建设为契机，广泛开展国际文化交流与合作，积极推进向西交流发展，已与俄罗斯等多个国家共建了8所“岐黄中医学院”和4个中医中心，与美国、韩国、澳大利亚、俄罗斯、法国、吉尔吉斯斯坦、摩尔多瓦、乌克兰、匈牙利等20多个国家和地区的学校和教育机构建立了友好合作关系。