2018中国大学排行榜中，福建中医药大学的排名情况是：
[1]在中国高校700强中，福建中医药大学排名第345名，相对于2017年排名上升了17名。
[2]在福建所有高校中，福建中医药大学排名第8名，相对于2017年排名保持不变。
[3]在所有医科类大学中，福建中医药大学排名第36名，相对于2017年排名上升了3名。
福建中医药大学历年排名统计
| 福建中医药大学历年排名表 | |||||
| 年度 | 全国排名 | 省内排名 | 分类 | 分类排名 | 总分 |
| 2018 | 345 | 8 | 医科 | 36 | 60.75 |
| 2017 | 328 | 8 | 医科 | 33 | 60.67 |
| 2016 | 359 | 10 | 医科 | 39 | 60.84 |
| 2015 | 335 | 8 | 医科 | 33 | 60.89 |
| 2014 | 329 | 8 | 医科 | 37 | 61.55 |
| 2013 | 296 | 8 | 医科 | 31 | 60.26 |
| 2012 | 322 | 8 | 医科 | 30 | 0.49 |
