合作办学：与华侨大学、福建医科大学结成对口支援协作关系。与中国社科院历史研究所、中科院西安光机所、莆田市委宣传部、莆田市文化广电新闻出版局、西门子（中国）公司、万好国际集团、赛得利（福建）纤维有限公司等150多个企事业单位开展政产学研合作。与英国邓迪大学、美国新奥良大学、新西兰梅西大学、澳大利亚西悉尼大学、澳大利亚卧龙岗大学等10多个国外大学开展交流合作，师生出国（境）访学、研修频繁。作为福建省首批闽台高校联合培养人才项目试点高校，与台湾实践大学、明道大学、嘉南药理大学、朝阳科技大学、弘光科技大学、新竹教育大学、大同大学开展合作办学。

服务地方：学校依托莆田学院政产学研领导小组平台，大力推动政产学研合作工作。通过举办“莆田学院产学研对接会”、参加6•18项目成果交易会等途径，积极推介、对接科研成果。成立10个校级“2011协同创新中心”、33支服务地方团队，积极与政府部门、行业协会、企业开展产学研合作，成立莆田市经济发展研究中心、莆田市旅游发展研究中心等地方智库，贴近莆田市产业发展的需要，与相关产业共建现代装备、电子信息、电子商务、工艺美术、医疗健康、食品与化工等6个产业学院，和相关六个专业群，并以此为契机，推进学校转型发展工作。强化妈祖文化研究特色，积极推动地方文化传承与创新工作，妈祖文化传承与发展协同创新中心成为第二批省级“2011协同创新中心”，妈祖文化研究中心成为第一批省社科研究基地和省高校人文社科优秀研究基地，还获批设立国家体育总局妈祖民俗体育文化研究基地、全国台联海峡两岸妈祖文化研习交流基地、福建省高等学校妈祖文化人文社科研究基地等国家、省级研究机构，成为福建省妈祖文化研究会的挂靠单位和会长单位。承办海峡论坛妈祖文化学术研讨会，主办“海峡两岸妈祖文化学术研讨会”，承担每年一次的妈祖祭典表演，为莆田市建设世界妈祖文化中心做出了积极贡献。