审计、税务（企业会计与税务）、市场营销、国际商务、国际贸易实务(国际物流与报关)、电子商务、连锁经营管理、计算机应用技术、计算机网络技术、嵌入式系统应用开发、软件技术、旅游管理、会展策划与管理、酒店管理(旅游与酒店管理)、旅游英语、装潢艺术设计、广告设计与制作、服装设计、旅游工艺品设计与制作、新闻采编与制作、文秘、信息传播与策划、主持与播音、应用英语、应用日语等。近年来，学校还与西南交通大学、北京语言大学、东北财经大学等联合办学，开办本科层次的网络教育、函授教育。学校十分重视教学与科研齐头发展。学校主办有国内外公开发行的学术刊物《福建商业高等专科学校学报》。学校教师主持或参与的各级、各类科研项目98项，其中省级3项，教育厅32项，在全国各级学术刊物上发表教研、科研论文700篇，出版专著11部，主编或参编教材37部，其中有3部教材获奖。学校拥有2门省级精品专业，省级教学成果奖2项，8门省级精品课程，4门省级精品课程立项。学校的人才培养工作成绩斐然。学校升格至今，已为社会培养了三万多名各类应用型商贸管理人才。随着市场经济的不断深入，学校提出“为商界打造人才，为人才打造品牌”的口号，重视学生“出口”，突出实践教学。毕业生以专业理论扎实、实践能力强、职业道德好、合作意识强、适应工作快、发展后劲足等特点深受用人单位欢迎。据省人事厅统计，学校2006、2007、2008年毕业生年底就业率分别达：97.5%、95.9%、98.1%。2007年，获得福建省高校毕业生就业工作评估检查高职高专组第一名。随着经济建设步伐的加快，教育改革的不断深入，学校坚持“以人为本，质量为先”的原则，继续深化改革、加快发展、提高质量，为培养高素质的应用型人才提供良好的环境，为建设海峡西岸经济区打造更多的复合型、应用型的“新一代闽商”人才。