学校是省教育厅确定的先行先试、开展闽台联合办学项目的本科高校之一，积极开展与台湾中国科技大学、中原大学、大叶大学、勤益科技大学、首府大学、东海大学、岭东科技大学、义守大学等高校的交流合作。同时，与复旦大学、厦门大学、北京林业大学、福州大学、福建师范大学、福建农林大学以及乌克兰哈尔科夫国立农业大学等高校建立了教学、科研合作关系。

学校传承“闽师之源”优良传统，崇尚“厚德博学”校训精神，弘扬新时代海西精神，努力营造良好的校风，涌现出“福建省师德模范”、“2009年感动福建十大人物”曹云露教授，“2010年全国高校辅导员年度人物入围奖”郭远景老师，2011年第三届全国“孝老爱亲”道德模范曹阳飞宇同学等一批师生先进典型。

在高等教育发展的新的历史机遇面前，三明学院正以学习实践科学发展观为动力，积极开展教育部本科教学评建工作，推进高等教育“质量工程”建设，全面实施“服务海西发展规划”，改革创新、强化内涵、突出特色、狠抓管理、提高质量，努力办成一所具有鲜明特色、居省内先进水平的地方本科高校。