现有附属医院（临床医学院）16所。此外，还有临床教学医院30所，非临床医学专业均有专业实践教学基地，形成了比较完善的临床教学与实践教学基地网络。有国家临床重点专科6个。
76载栉风沐雨，艰苦奋斗，开拓进取，争创一流，学校教学科研实力显著增强，学术水平不断提高，学校面貌发生深刻变化，取得了教学、科研、医疗的丰硕成果，64000多名毕业生遍布海内外医疗卫生、科研领域，为提高人民群众健康水平提供了强有力的人才保障和智力支持，为福建医疗卫生事业和现代化建设作出了重要贡献。目前，学校正致力于建设成为海峡西岸经济区医药卫生人才培养、科学研究与开发、临床诊疗、疾病预防、健康保健及社会服务中心，力争跨入全国医学院校前10%。
