| 牡丹江医学院历年排名表 | |||||
| 年度 | 全国排名 | 省内排名 | 分类 | 分类排名 | 总分 |
| 2018 | 518 | 19 | 医科 | 61 | 60.37 |
| 2017 | 569 | 19 | 医科 | 65 | 60.26 |
| 2016 | 509 | 19 | 医科 | 60 | 60.47 |
| 2015 | 506 | 18 | 医科 | 53 | 60.48 |
| 2014 | 472 | 17 | 医科 | 54 | 61.35 |
| 2013 | 546 | 16 | 医科 | 58 | 60.02 |
| 2012 | 508 | 16 | 医科 | 52 | 0.06 |
通过上述牡丹江医学院排名走势图可以看出，相对于2017年，牡丹江医学院在全国排名中下降了51名；在黑龙江省内排名保持不变；在医科类院校中排名下降了4名。
四、牡丹江医学院在全国的排名位次
在2018年全国高校排行榜中，和牡丹江医学院排名比较接近的大学有湖南财政经济学院和宜宾学院，不想就读牡丹江医学院的同学，可以考虑下这两个学校。另外排名和牡丹江医学院比较接近的大学还有：
