| 福建中医药大学历年排名表 | |||||
| 年度 | 全国排名 | 省内排名 | 分类 | 分类排名 | 总分 |
| 2018 | 345 | 8 | 医科 | 36 | 60.75 |
| 2017 | 328 | 8 | 医科 | 33 | 60.67 |
| 2016 | 359 | 10 | 医科 | 39 | 60.84 |
| 2015 | 335 | 8 | 医科 | 33 | 60.89 |
| 2014 | 329 | 8 | 医科 | 37 | 61.55 |
| 2013 | 296 | 8 | 医科 | 31 | 60.26 |
| 2012 | 322 | 8 | 医科 | 30 | 0.49 |
通过上述福建中医药大学排名走势图可以看出，相对于2017年，福建中医药大学在全国排名中上升了17名；在福建省内排名保持不变；在医科类院校中排名上升了3名。
四、福建中医药大学在全国的排名位次
在2018年全国高校排行榜中，和福建中医药大学排名比较接近的大学有大连海洋大学和青岛农业大学，不想就读福建中医药大学的同学，可以考虑下这两个学校。另外排名和福建中医药大学比较接近的大学还有：
