| 南京中医药大学历年排名表 | |||||
| 年度 | 全国排名 | 省内排名 | 分类 | 分类排名 | 总分 |
| 2018 | 182 | 18 | 医科 | 13 | 61.62 |
| 2017 | 191 | 19 | 医科 | 13 | 61.32 |
| 2016 | 178 | 18 | 医科 | 13 | 61.94 |
| 2015 | 168 | 17 | 医科 | 13 | 62.03 |
| 2014 | 191 | 17 | 医科 | 17 | 62.08 |
| 2013 | 195 | 18 | 医科 | 19 | 60.66 |
| 2012 | 184 | 17 | 医科 | 17 | 1.69 |
通过上述南京中医药大学排名走势图可以看出，相对于2017年，南京中医药大学在全国排名中下降了9名；在江苏省内排名下降了1名；在医科类院校中排名保持不变。
四、南京中医药大学在全国的排名位次
在2018年全国高校排行榜中，和南京中医药大学排名比较接近的大学有延边大学和济南大学，不想就读南京中医药大学的同学，可以考虑下这两个学校。另外排名和南京中医药大学比较接近的大学还有：
