学校现有附属医院8所(综合性医院5所，儿童医院、口腔医院、康复医院各1所)。在《中国最佳医院综合排行榜》(全国100所)中，附属儿童医院、附属第一医院、附属第二医院分别排名第57位、第73位、第81位。各附属医院共拥有国家临床重点专科28个。医院编制床位10600余张，年门诊量逾800万人次，年收治住院病人近30万人次。此外，有14所非直属附属医院和30多所教学医院分布在重庆、四川及深圳等地。

学校坚持自主创新，科学研究能力和水平不断提升，“十二五”以来，牵头承担国家科技重大专项、国家重大科研仪器研制专项、国家重大科学研究计划项目、国家重点基础研究发展计划(973计划)项目、国家高技术发展研究计划(863计划)项目、国家科技计划支撑项目、教育部新世纪优秀人才项目、国家自然科学基金项目670余项。获各类科技成果奖励110余项，其中重庆市科学技术奖、何梁何利奖等省部级以上奖励40余项。学校独立研制的高强度聚焦超声肿瘤治疗系统(海扶刀)属世界首创，是我国第一台具有完全自主知识产权的大型医疗设备，量产后获得国内外业界广泛认可。

学校积极开展国内外交流合作，近年来与美国、英国、法国、日本、加拿大、澳大利亚、比利时、瑞典、新西兰、韩国、马来西亚等10多个国家或地区的20余所高水平大学开展研究生、七年制和本专科生联合培养，以及科学研究合作。与复旦大学、华中科技大学、西南大学等“985工程”、“211工程”大学联合培养长年制医学生。

建校60年来，学校在人才培养、科学研究和医疗服务等方面取得突出成绩，为我国的医学教育和卫生事业发展，以及服务地方经济建设作出了重要贡献。今天，全体重医人团结拼搏、锐意进取、开拓创新，正在为加快建成学科优势突出，办学特色鲜明，国际化、开放型的高水平医科大学而努力奋斗!