根据教育部、卫生部签署的清华大学与我校紧密合作办学协议，以及两校关于落实两部协议的实施意见，协和医大进入了“211”和“985”工程建设项目。目前学校设有基础医学院、临床医学院、护理学院、公共卫生学院、研究生院、继续教育学院等6个学院，已建成由博士后、博士、硕士、本科生、专科生教育以及成人教育组成的多层次医学教育体系。学校现有全日制学生4004人，其中研究生3129人，本科生642人，专科生233人。本专科生在北京、天津、上海、重庆、江苏、浙江、河北、湖南、安徽、广东、福建、四川、山东、湖北等14个省市招生。
