学校学科力量雄厚。现有8个国家重点学科，2个国家重点（培育）学科，56个国家临床重点专科（含中医），14个国家中医药管理局重点（培育）学科，4个北京市一级重点学科，6个北京市二级重点学科，1个北京市重点交叉学科，2个北京市一级重点建设学科，6个北京市二级重点建设学科，1个北京地区高等学校学科群。5个国家临床医学研究中心,1个省部共建国家重点实验室培育基地，4个教育部重点实验室，41个北京市重点实验室。有8个一级学科博士学位授权点和11个一级学科硕士学位授权点；按照三级学科统计，有59个博士学位授权点和78个硕士学位授权点。有9个博士后科研流动站。

学校本专科专业齐全，设置的长学制专业中有临床医学（包括儿科方向）和口腔医学；本科专业中有临床医学、基础医学、口腔医学、预防医学、药学、中医学、中药学、护理学、生物医学工程、假肢矫形工程、康复治疗学、公共事业管理（卫生管理）、医学实验技术、法学（卫生法学）、临床药学、医学检验技术等16个专业。高职高专教育设有护理、医学检验技术、药学等14个专业。现有全日制在校生10604人，其中研究生3132人，长学制学生1561人，本科生3368人，高专高职生2067人，留学生476人；成教学生5004人。学校培养医学与医学相关学科的学术型和应用型人才，形成了全方位、多层次、创新型人才培养模式。

学校目前有教育部、卫生计生委“卓越医生教育培养计划”试点项目4个，7个国家级特色专业和10个市级特色专业，7门国家级精品课程和18门市级精品课程，5门国家级精品资源共享课程，1门国家级精品视频公开课，3个国家级实验教学示范中心和5个市级实验教学示范中心，3个国家级人才培养模式创新实验区和1个市级人才培养模式创新实验区，1个国家级大学生校外实践教育基地，4个北京市级校外人才培养基地和1个素质培养基地，7个国家级优秀教学团队和11个市级优秀教学团队，1名国家级教学名师和18名市级教学名师。通过教育教学改革实践，学校共获得教育教学成果奖国家级特等奖1项、二等奖6项，市级特等奖2项、一等奖15项、二等奖23项。

学校具有较强的学术发展与科研实力，在校本部和附属医院拥有一批国家级和市级重点学科和重点实验室的基础上，建有高水平的国家级、市级研究和培训机构，如国家生命科学与技术人才培养基地、卫生部全科医学培训中心、北京市全科医学培训中心、首都卫生管理与政策研究基地等。有1个国家工程技术研究中心、4个教育部工程研究中心、7个北京市工程技术研究中心。有4个教育部创新团队，2个科技部重点领域优秀创新团队。近5年来，学校承担了国家“973”、“863”、国家自然科学基金、国家社会科学基金、北京市自然基金，以及国家教育部、卫生计生委、科技部、北京市科委、北京市教委等科研项目2554项（其中国家级科研项目1289项），累计科研经费18.8亿元；获得各类各级奖励74项，其中国家科技进步奖6项、北京市科技奖22项、教育部高等学校科学研究优秀成果奖15项、教育部人文社科奖2项、北京市哲学社会科学优秀成果奖3项、中华医学科技奖20项、何梁何利科学与技术进步奖1项、吴阶平医学奖4项、茅以升北京青年科技奖1项；获得专利授权364项。神经生物学、细胞生物学、基础免疫学、医学图像处理、生物信息检测与处理、神经内科、神经外科、心脏内外科、肾移植、呼吸内科、消化内科、口腔生物医学、眼科、耳鼻咽喉科、小儿血液病等在国内外享有较高的声誉。