国家品牌专业10个：机械设计制造及其自动化、车辆工程、电气工程及其自动化、材料成型及控制工程、新能源材料与器件、物联网工程、土木工程、测控技术与仪器、资源勘查工程、制药工程。

国家重点专业1个：建筑学。

省部重点专业3个：工程力、思想政治教育、环境工程。

合肥工业大学特色专业

机械设计制造及其自动化

可谓是合肥工业大学在当今高科技实力与高素质人才角逐中制胜的“杀手锏”，也是合肥工业大学人数最多，实力最强、影响力最大的专业，该专业提倡培养“一专多能”型的复合型人才，专业涵盖原机械制造工艺与设备、机械设计及制造、机械电子工程、汽车与拖拉机和真空技术及设备等九个专业，培养出来的学生个个都是多面手，很多单位都抢着要!

测控技术与仪器

专业是安徽省教改示范专业，学院拥有现代测试与制造质量工程安徽省高等学校重点实验室、现代精度工程研究中心、纳米测量实验室、“211工程”重点建设研究室等研究基地，设有中心实验室、本科生、研究生科技创新基地等实践基地，为学生提供了得天独厚的实践条件。

车辆工程

是在合肥工业大学原汽车专业的基础上拓展而成的新专业，也是这个学校的一大亮点。车辆电子与控制技术，如汽车底盘系统的智能控制、车辆动力学与现代设计技术等都是走在前端的学科。在这里学生不仅要学习车辆设计方面的知识，而且还要学习车辆制造、营销以及管理等知识，为学生以后的发展打好了坚实的基础。