学校现设有临床医学（七年制）、临床医学（五年制）、口腔医学、预防医学、生物技术、护理学、公共事业管理、药学、中药学、医事法学、食品质量与安全、临床药学、生物医学工程等24个本科专业。拥有临床医学、药学2个博士学位授权一级学科点，26个博士学位授权学科点，拥有临床医学博士专业学位授予权，有10个硕士学位授权一级学科点，74个硕士学位授权学科点。建立了药学、临床医学、公共卫生与预防医学3个博士后科研流动站。皮肤病与性病学为国家重点学科，中药药理学、中医肿瘤病学为国家中医药重点学科，有12个国家临床重点专科，19个省级重点学科，42个省级临床医学重点学科和重点扶持学科；建有1个科技部省部共建国家重点实验室培育基地，2个教育部重点实验室、13个中央（财政部）与地方共建实验室，25个省级以上（重点）实验室（工程技术中心、科技公共服务平台、人文社科研究基地），是国家药品临床研究基地。有1个教育部科技创新团队，2个安徽省科技创新团队，3个安徽省“115”科技产业创新团队。跻身国家“中西部高校基础能力提升工程”，是国家级大学生创新创业训练计划承担高校。有4个国家级高等学校特色专业建设点，2个国家级专业综合改革试点，3个国家级卓越医生教育培养计划项目；1个国家级教学团队；2个国家级精品课程和精品资源共享课程；2个国家级实验教学示范中心,1个国家级虚拟仿真实验教学中心；1名国家“万人计划”教学名师。1门课程入选教育部来华留学英语授课品牌课程。获得国家级教学成果二等奖一项。

在职教职工7900余人（含直属附属医院教学职称人员），专任教师队伍中具有博士、硕士学位的教师占88.72%。现有国家“百千万人才工程”，“新世纪优秀人才”，教育部骨干教师，卫生部、人事部突出贡献中青年专家，全国首批青年拔尖人才，“百人计划”，“皖江学者”特聘教授，高校领军人才等30人次。高校高端人才引进团队2个，省部级创新团队6个。有16人次在国际学术组织和SCI源期刊任职，6人次担任国家“十一五”、“十二五”规划教材主编。3人担任国家级专科学会主委，1人在亚洲学术组织担任主席，9人入选教育部高校医药学科指导委员会专家。10多人获得全国、全省模范教师、优秀教师光荣称号。

全日制在校生共19000余人，其中研究生3900余人，留学生340余人。近5年来，学校共承担“863”、“973”计划、国家科技支撑计划和国家自然科学基金项目等470余项。国家自然科学基金立项数近年来保持安徽省属高校领先地位。研究成果分别入选2010、2016年度中国科学十大进展和2012年度中国高校十大科技进展。获国家科技进步二等奖一项、高校自然科学技术奖高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）一等奖一项、中华医学科技奖一等奖三项、中华医学科技奖医学科普奖和卫生管理奖各1项。先后以责任作者单位在《新英格兰医学杂志》、《细胞》、《自然·遗传》等国际著名SCI刊物发表多篇高水平研究论文。