蒙古药学专业学生主要面向蒙古医疗机构、蒙古药生产与经营企业、药品质量检验机构，在蒙古药种植、制剂生产、质量检验、市场营销与管理等岗位群，从事蒙古药种植、鉴定、预处理、炮制、制剂生产、质量检验、市场营销与管理等工作。 蒙医学包括基础理论、蒙药与蒙药方剂、临床各科等几大学科。蒙医基础理论主要研究人体生理、病理、疾病诊断和治疗原则、治疗方法等，对临床各科有指导意义的学科。蒙医学理论来源于临床实践，又反过来指导临床实践，并在实践中不断得到充实和发展。 蒙古药学专业培养具有蒙古药学基本理论、基本知识和基本实验技能及其相关蒙古药学、药学等知识和能力，在蒙古药生产、检验、流通、使用和研发领域从事蒙古药鉴定、设计、制剂和临床合理药用等工作的高级科技人才。 蒙药学专业的学生主要学习蒙药学各主要分支学科的基本理论和知识，受到蒙药学实验方法和技能的系统训练，具有蒙药鉴定、蒙药炮制、蒙药制备、质量控制评价的基本能力。