上海第二医科大学(原名上海第二医学院)由圣约翰大学医学院(1896-1952)、震旦大学医学院(1911-1952)、同德医学院(1918-1952)于1952年全国高等学校院系调整时合并而成。1997年学校通过了“211工程”正式立项，是国家重点建设的“211工程”大学之一。2002年又通过了“211工程”“九五”项目验收和“十五”建设项目论证。
学校现有教职医护员工12400人，其中专业技术人员10168名，具有高级职称的在职人员1340名。目前在校生5700多名，其中博士生和硕士生千余名，占全校学生总数的23%，建校以来已培养毕业生25000余名。
学校有13个学院；1个校直属系（部）；1所全国重点卫生学校；5所综合性附属医院；1所专科性附属医院，15所教学医院，126个教研室。有2个七年制专业，6个本科专业，6个三年制高职高专专业，有博士后流动站3个，二级学科博士点31个，硕士点47个。
学校共有74个学科，其中国家级重点学科6个，上海市重点学科7个（其中“重中之重”学科2个），上海市教委重点学科22个，上海市医学领先专业9个，设有15个市级研究所，3个研究（培训）中心，2个世界卫生组织合作中心，1个国家重点实验室，1个教育部重点实验室，3个卫生部重点实验室和1个市属高校开放实验室。
分省排名 | 全国排名 | 校名 | 学校类型 | 学校参考类型 | 备注 | |
1 | 4 | 上海交通大学 | 综合 | 理科类 | 研究1型 | 国家重点建设大学 |
2 | 5 | 复旦大学 | 综合 | 综合类 | 研究1型 | 国家重点建设大学 |
3 | 19 | 同济大学 | 理工 | 工学类 | 研究2型 | 985工程大学 |
4 | 33 | 华东师范大学 | 师范 | 文理类 | 研究2型 | 985工程大学 |
5 | 35 | 华东理工大学 | 理工 | 工学类 | 研究1型 | 211工程大学 |
6 | 43 | 上海大学 | 综合 | 综合类 | 研教1型 | 211工程大学 |
7 | 65 | 东华大学 | 理工 | 工学类 | 研教1型 | 211工程大学 |
8 | 86 | 上海财经大学 | 财经 | 经管类 | 研教1型 | 211工程大学 |
9 | 97 | 上海师范大学 | 师范 | 文理类 | 研教2型 | |
10 | 103 | 上海理工大学 | 理工 | 文理类 | 研教2型 | |
11 | 172 | 华东政法大学 | 政法 | 文科类 | 教研1型 | |
12 | 177 | 上海中医药大学 | 医药 | 医学类 | 研教2型 | |
13 | 180 | 上海外国语大学 | 语文 | 文学类 | 研教1型 | 211工程大学 |
14 | 212 | 上海海洋大学 | 农业 | 文理类 | 教研1型 | |
15 | 221 | 上海海事大学 | 理工 | 文理类 | 教研1型 | |
16 | 283 | 上海工程技术大学 | 理工 | 文理类 | 教研2型 | |
17 | 300 | 上海体育学院 | 体育 | 体育类 | 教研1型 | |
18 | 315 | 上海音乐学院 | 艺术 | 艺术类 | 教研1型 | |
19 | 317 | 上海应用技术学院 | 理工 | 文理类 | 教学1型 | |
20 | 343 | 上海对外经贸大学 | 财经 | 经管类 | 教学1型 | |
21 | 360 | 上海电力学院 | 理工 | 文理类 | 教学1型 | |
22 | 473 | 上海第二工业大学 | 理工 | 文理类 | 教学1型 | |
23 | 483 | 上海政法学院 | 政法 | 文科类 | 教学1型 | |
24 | 489 | 上海戏剧学院 | 艺术 | 艺术类 | 教研1型 | |
上海立信会计学院 | 财经 | 文科类 | 教学1型 | |||
上海电机学院 | 理工 | 文理类 | 教学1型 | |||
上海金融学院 | 财经 | 文科类 | 教学1型 | |||
上海商学院 | 财经 | 经管类 | 教学1型 | |||
上海海关学院 | 财经 | 经管类 | 教学1型 | |||
