学校创办于1934年，时名湖南国医专科学校，1960年改办为普通高等本科院校湖南中医学院，1990年原湖南科技大学成建制并入湖南中医学院，2002年湖南省中医药研究院与湖南中医学院合并，2006年经教育部批准更名为湖南中医药大学。2012年学校进入一本招生序列。目前学校与湖南省中医药研究院实行校院合一的管理体制。

学校现有含浦、东塘2个校区，总占地面积1000余亩，校舍建筑面积47万平方米。现有3所直属附属医院，13所非直属附属医院，5个校办合资企业。学校下设17个学院、16个研究中心（所）。学校现有学生总人数46006人，其中研究生1843人、全日制本科生18339人、专科生189人、成人学历教育学生22222人、境外学生407人。学校图书馆藏书109.7万册，线装古籍2.5万余册。拥有教学科研仪器设备总值1.50亿元，有40万元以上的贵重仪器设备17台件、多媒体教室165间，建成了先进的校园网络和多媒体教学、教室监控、教学广播、会议视频、屏蔽系统。

学校始终把提高教学质量作为第一要务来抓，不断创新教育理念，优化专业结构，深化教学内容、课程体系与实践教学改革，强化中医本科人才临床（诊疗）思维和实践能力的培养，实施了农村订单定向免费医学生（中医学）培养项目，实施了临床型拔尖中医人才培养体制的构建与实践改革试点项目，大力推进素质教育，取得了显著成效。目前，学校开设24个本科专业，分属于医学、理学、工学、管理学、文学5个学科门类。现有4个国家级特色专业建设点，7个省级特色专业建设点；国家级本科专业综合改革试点1个，省级本科专业综合改革试点2个。学校现有国家级精品课程1门，国家级精品资源共享课1门，省级精品课程9门。学校历来重视人才培养工作，本科生参与课外科技活动的普及率不断增高，获得各类国家级、省级学科和科技竞赛奖百余项，近3年本科毕业生年终就业率平均为96.5%，位居全省高校前列。

学校构建了以医学学科为主体，医、理、工、管、文等学科门类协调发展的学科体系。拥有中医学、中西医结合2个博士后科研流动站。现有一级学科博士学位授权点1个，二级学科博士学位授权点22个，其中8个二级学科自主设置博士学位授权点；一级学科硕士学位授权点4个，二级学科硕士学位授权点41个，其中17个二级学科自主设置硕士学位授权点。