广西医科大学创建于1934年11月21日，坐落在具有“绿城”之称的广西壮族自治区首府南宁市，校本部占地面积71万多平方米。前身是广西省立医学院。1940年校址迁至桂林。1949年以前，学校在战乱中七次迁徙校址，三次变更校名。1949年11月更名为广西省医学院。1952年由中央卫生部委托中南卫生部直接领导。1953年4月中央卫生部批准改称为广西医学院。1954年7月由桂林迁回南宁市现址至今。1996年5月教育部批准更名为广西医科大学。
学校是全国建校较早的22所医学院校之一，是全国最早定点招收外国留学生、港澳台学生和华侨学生的8所医学院校之一，是教育部批准的有招收本科临床医学专业（英语授课）留学生资格的首批30所高校之一，是广西政府重点建设的大学之一，是广西医学教育、医学研究、临床医疗和预防保健的中心。

校本部共设有16个学院、2个教学部，即：基础医学院、公共卫生学院、第一临床医学院（东院）、第二临床医学院（西院）、肿瘤医学院、口腔医学院、护理学院、药学院、研究生学院、继续教育学院、高等职业技术学院、国际教育学院、人文社会科学学院、外国语学院、全科医学院、信息与管理学院、体育部、思政部。
2008年，学校获教育部本科教学工作水平评估优秀成绩。
2011年，作为国家正式实施医学专业认证后的第一所医学院校通过了教育部临床医学专业认证、全国第三所大学接受并通过了护理学专业试点认证。
2015年，临床医学博士专业学位授权点顺利通过教育部全国医学专业学位教育指导委员会专家组专项现场评估、公共卫生专业硕士学位授权点顺利通过教育部公共卫生专业硕士学位专项评估工作专家组的专项评估、口腔医学本科专业顺利通过教育部口腔医学本科专业认证委员会专家的认证工作。
师资队伍素质高，学生规模范围广。学校现有专任教师1529名，其中具有研究生学位教师1225人，博士学位教师428人，正高职称437名，副高职称508名，高级职称教师占61%，硕士及以上学位教师占87.4%，国家“千人计划”短期项目创新人才1名，“新世纪百千万人才工程”国家级人选3名，国家有突出贡献的中青年专家8名，教育部新世纪优秀人才支持计划入选者9名，享受国务院政府特殊津贴专家73名，“八桂学者”4名、广西“特聘教授5名，广西“新世纪十百千人才工程”第二层次人选35名，以及一批选聘任中华医学会专业学会常委、委员和广西医学会各专业学会主任委员、中华医学会系列杂志编委近100名，还有一批优秀人才被选为国家级和省级高校中青年学科带头人等人才工程重点培养对象。